بناءً على رؤية ومنهج البرنامج، يسعى برنامج PERSGA LMR لتنمية القدرات والتعاون الإقليمي لتحقيق الهدفين الإستراتيجيين الرئيسيين التاليين:

1. استدامة الموارد البحرية الحية وسلامة موائلها والتنوع البيولوجي، من أجل تأمين رفاهية النظام الإيكولوجي والرفاه الاقتصادي للأجيال الحالية والمستقبلية في الإقليم ؛
2. . تحقيق أهداف الحماية والصون، وممارسات الصيد الرشيد وتربية الأحياء المائية المسؤولة ، مع مراعاة جميع الجوانب البيولوجية والتكنولوجية والاجتماعية والاقتصادية والبيئية ذات الصلة.

لتحقيق هذه الأهداف الإستراتيجية، مع الاخذ بعين الاعتبار أولويات الإقليم، يقوم البرنامج بتنفيذ العديد من الأنشطة وتطوير الأدلة الإرشادية الإقليمية ودعم القدرات في المجالات التالية:

• تطوير استراتيجيات وسياسات وخطط إدارة الموارد البحرية الحية بالبناء على أفضل المعلومات العلمية والمعارف المتاحة، والتشاور مع أصحاب المصلحة ؛
• تدابير الحماية والصون والإدارة الفعالة للتنوع البيولوجي والموائل الحرجة للموارد البحرية الحية مع التركيز بشكل خاص على الأنواع المهددة ، والمناطق البحرية المحمية وملاجئ الأسماك ؛
• التحكم في الصيد الجائر والصيد غير المشروع وغير المنظم وغير المبلغ عنه ؛
• تعزيز تدابير الرصد والتحكم والمراقبة في إدارة مصايد الأسماك ؛
• تبني سياسات الحماية البيئية والاجتماعية الشاملة (ESS) لتأثيرات أنشطة ومشروعات تربية الأحياء المائية ومصايد الأسماك، ومشاريع البنية التحتية وعمليات الصيد والاستزراع.
• التحكم في جميع أنواع التلوث الناجم عن أنشطة مصايد الأسماك وتربية الأحياء المائية
• اعتماد مبادئ منهج النظام الإيكولوجي في إدارة مصايد الأسماك وتربية الأحياء المائية
• تعزيز دور الموارد البحرية الحية وإسهامها في تحقيق أهداف التنمية المستدامة ذات الصلة ، مثل الهدف 1 (تقليص للفقر) ، والهدف 2 (الأمن الغذائي) ، والهدف 3 (الصحة والرفاهية) ، والهدف 8 (العمل اللائق والنمو الاقتصادي) ، والهدف 12 (الاستهلاك والإنتاج المستدامان) ، والهدف 13 (التغير المناخي)، و الهدف 14 (الحياة تحت الماء).