تعتبر المناطق البحرية المحمية (MPAs) أداة رئيسية لإدارة الحفظ  وحماية البيئة الساحلية والبحرية. وتتراوح المناطق المحمية من حيث المساحة بين المناطق الكبيرة الواسعة والمناطق متعددة الاستخدامات إلى المناطق الأصغر. ويعتبر النوع الأخير هو الأكثر شيوعًا والتي عادةً ما تكون جميع الأنشطة الاستخراجية أو بعض الأنشطة الاستخراجية فيها محظورة أو محددة.

كما أن المناطق البحرية المحمية هي مواقع يتم فيها تنظيم أنواع معينة من الأنشطة البشرية ، وخاصة صيد الأسماك ، وتكون القيود المفروضة أكثر مما هو خارج حدود تلك المناطق. ومع ذلك ، فإن استخدام المناطق البحرية المحمية ، مع استثناءات ملحوظة ، لا يزال غير معقد في غالبية الحالات. كما أنه يتم أحياناً إنشاء المناطق البحرية المحمية (MPAs) بهدف استعادة الموائل المتدهورة ، وللسماح باستعادة المخزون بعد الصيد المفرط ، لحماية أنواع أو أنظمة رئيسية أو هامة من التنوع البيولوجي، وذلك لدعم مصايد الأسماك في المناطق المحيطة ، ودعم النمو الاقتصادي.

وفي إقليم الهيئة قد تم إعلان محميات بحرية (MPAs) عديدة في أجزاء كثيرة من البحر الأحمر وخليج عدن كأدوات لتوفير الصون والحماية ولضمان الاستخدام المستدام للموارد البحرية، والتنمية الاقتصادية.  ومن الأهمية بمكان الحفاظ على المناطق التي تمثل مجموعة من الموائل والتنوع البيولوجي الفريد في المنطقة ودعم التنمية الوطنية. وقد بدأ هذا من خلال إنشاء شبكة إقليمية مكونة من  12 محمية بحرية تمثل جميع البيئات والأنواع والموائل على طول سواحل وجزر البحر الأحمر وخليج عدن.